پانکراتیت‌ مزمن در اثر التهاب پیشرونده و آسیب برگشت‌ناپذیر به ساختار و عملکرد (غدد برون‌ریز و درون‌ریز) پانکراس ایجاد می شود. مصرف بیش از حد الکل شایعترین عامل شناخته شده است که به دنبال آن انسداد مجاری پانکراسی رخ می‌دهد. پانکراتیت ایدیوپاتیک تا ۳۰٪ موارد را شامل می‌شود. بیماران ممکن است بدون علامت باشند و یا با درد شکم و ویژگی‌های کمبود آنزیم‌های پانکراسی (مانند استئاتوره ، کاهش وزن، عدم تحمل گلوکز) همراه باشند.

گاستریت آتروفیک به التهاب مزمن مخاط معده همراه با آتروفی، از بین رفتن غدد و تغییرات متاپلازی سلول‌های پوششی معده گفته می‌شود. این بیماری براساس منشاء به دو گروه گاستریت آتروفیک خودایمن (AMAG) و گاستریت آتروفیک اکتسابی از محیط (EMAG) تقسیم می‌شود.